USB 2.0とUSB 3.0の物理回路設計が異なるためです。​

USB 3.0コネクタには、従来のUSB 2.0の4本の信号線（VBUS、D+、D–、GND）に加え、高速データ転送専用の第5本のSuperSpeed信号線（TX/RXペア）が含まれています。​

しかし、USB 2.0デバイスはD+とD–の差動ペアのみを使用し、SuperSpeed信号線には接続されません。​

そのため、xHCIコントローラがデバイスを列挙すると、デバイスがUSB 2.0モードのみをサポートしていることを検出します。​
結果として、ポートはHigh-Speed（480 Mbps）モードで動作し、SuperSpeed（5 Gbps / 10 Gbps）は有効になりません。​